首都体育学院体育保健康复系（运动人体科学专业）始建于1990年。1988年前国家教委审定全国普通高等学校专业目录时，委托我院调研、论证体育保健康复专业。调研、论证成功后，经前国家教委审定，于1989年颁布的普通高等学校专业目录时，在体育学类目录中首次增设了体育保健康复专业。同年国家教委下文要求我院在全国率先试点开设该专业，为此，我校于1990年开始建系、招生，成为全国最早开设体育保健康复专业的院校之一。1998年教育部再次审定专业目录时，本着科学、规范、拓宽的原则，将该专业更名为运动人体科学专业。
在各级领导的关怀和学院的正确领导下，在全系师生员工的共同努力下，经过多年的办学积累，造就出了一支以北京市教学名师姚鸿恩教授为首的，富有敬业精神，学术水平高，知识结构、年龄结构、职称结构合理的教学、科研与管理队伍。本专业下设三个重点教研室，即体育保健康复教研室、生理生化教研室、解剖生物力学教研室。1993年10月该专业批准为硕士学位授予权单位。在人才培养方面我们坚持紧密围绕应用型人才的培养目标，推进全面素质教育，依据厚基础、宽专业、注重能力培养的原则，从社会需求的实际出发，发展、完善其知识结构与能力结构。
